Quando ele era criança, Murakami estava apaixonado por uma garota que ele chamava de Kuroneko. Ela insistiu em saber sobre alienígenas e em tê-los conhecido, mas ninguém acreditou nela, mesmo o jovem Murakami estava cético. Um dia, ela decide mostrar a ele os alienígenas, mas ocorre um acidente e Kuroneko morre enquanto Murakami fica gravemente ferido no hospital. Os anos passam e Murakami fica obcecado em encontrar provas da existência de alienígenas por causa de uma promessa que havia feito com Kuroneko. Então, um dia, um novo aluno transferido chega à sua classe, que não só se parece muito com Kuroneko, mas se chama Kuroha Neko! E mesmo que ela insista em nunca ter conhecido Murakami antes, a garota tem força sobre-humana e parece até ser capaz de prever o futuro! Como a vida de Murakami mudará agora que ele foi salvo por essa garota misteriosa que afirma ser uma maga?
