Evolução de Aquário

12.000 anos após os acontecimentos de Sousei no Aquarion, a humanidade é ameaçada por um novo inimigo de outra dimensão denominado “Abdutores”, que assim como os Anjos das Sombras, invadem as cidades humanas para sequestrar seus habitantes. Para defender a humanidade desta invasão, a organização Neo-DEAVA estabeleceu duas equipes, uma composta apenas por homens e outra apenas por mulheres, cada uma pilotando suas próprias máquinas gigantes chamadas “Aquaria”. Para proteger seu novo amigo Mikono, o adolescente Amata Sora decidiu usar os poderes que manteve em segredo durante toda a sua vida e, ao combinar vetores com pilotos masculinos e femininos em um único robô, o lendário gigante Aquarion renasce mais uma vez.