É (Yuuki Homura)

Num futuro próximo, um cientista japonês projeta um exoesqueleto motorizado chamado “Infinite Stratos” (IS). Possuindo tecnologia e capacidades de combate muito mais avançadas do que qualquer outro sistema de armas, o IS ameaça desestabilizar o mundo. Diante de uma arma tão poderosa, as nações do mundo promulgam o "Tratado do Alasca", que afirma que o EI nunca será usado para combate militar e que a tecnologia IS existente deve ser distribuída igualmente a todas as nações, para evitar que qualquer nação domine os outros. A introdução do SI tem, no entanto, um grande efeito na sociedade. Como o IS só pode ser operado por mulheres, o equilíbrio de poder entre homens e mulheres é rompido, com as mulheres passando a dominar a sociedade sobre os homens.
Dez anos após a introdução do primeiro SI, o mundo entrou em uma nova era de paz. A paz é abalada, no entanto, por uma descoberta inesperada. Descobriu-se que um garoto japonês de 15 anos de idade, chamado Ichika Orimura, é capaz de operar um IS. Percebendo o potencial, Ichika é forçada pelo governo japonês a frequentar a prestigiosa Academia Infinite Stratos, uma academia internacional onde são treinados pilotos de IS de todo o mundo. Assim, começa sua movimentada vida escolar, cercada por meninas.